Il partenariato del progetto Wagon2Africa è costituito 10 università (pubbliche o private).

• Università Politecnico di Torino (Capofila)
• Università degli Studi di Palermo
• Luiss Libera Università internazionale degli studi sociali Guido Carli
• Università degli Studi di Bari Aldo Moro
• Università degli Studi di Bologna
• Università degli Studi di Foggia
• Università degli Studi di Firenze
• Università degli Studi di Napoli Federico II
• Università degli Studi di Sassari
• Università degli Studi di Torino 

Il progetto attualmente beneficia del supporto di circa 61 istituzioni provenienti da 14 paesi dell'Africa orientale, comprese 49 università che hanno firmato una lettera di supporto specifica che conferma l'impegno per il progetto, e 34 accordi attuali con le istituzioni italiane della partnership.