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SIMONA ESTER ROMBO

Curriculum e ricerca

ROMBO SIMONA ESTER

SIMONA ESTER ROMBO

 (INF/01)

Matematica e Informatica

Insegnamenti

Anno accademico Codice della materia Nome della materia CFU Corso di studi
2019/2020 19976 BIG DATA MANAGEMENT (MODULO) 6 INFORMATICA
2019/2020 03968 INGEGNERIA DEL SOFTWARE 6 INFORMATICA

Pubblicazioni

Data Titolo Tipologia Scheda
2019 Design and Prototyping of a Smart University Campus Capitolo o Saggio Vai
2019 Analyzing big datasets of genomic sequences: Fast and scalable collection of k-mer statistics Articolo in rivista Vai
2019 FEDRO: a software tool for the automatic discovery of candidate ORFs in plants with c →u RNA editing Articolo in rivista Vai
2019 Algorithms for Graph and Network Analysis: Graph Alignment Capitolo o Saggio Vai
2019 Algorithms for Graph and Network Analysis: Clustering and Search of Motifs in Graphs Capitolo o Saggio Vai
2019 DNA combinatorial messages and Epigenomics: The case of chromatin organization and nucleosome occupancy in eukaryotic genomes Articolo in rivista Vai
2018 An Integrative Framework for the Construction of Big Functional Networks Contributo in atti di convegno pubblicato in volume Vai
2018 Efficient algorithms for sequence analysis with entropic profiles Articolo in rivista Vai
2018 In vitro versus in vivo compositional landscapes of histone sequence preferences in eucaryotic genomes Articolo in rivista Vai
2017 (Discriminative) Pattern Discovery on Biological Networks Monografia Vai
2017 2D motif basis applied to the classification of digital images Articolo in rivista Vai
2017 Foreword: Algorithms, Strings and Theoretical Approaches in the Big Data Era – Special Issue in Honor of the 60th Birthday of Professor Raffaele Giancarlo(Editorial) Curatela Vai
2017 Network Centralities and Node Ranking Capitolo o Saggio Vai
2016 Discovering new proteins in plant mitochondria by RNA editing simulation Contributo in atti di convegno pubblicato in volume Vai
2016 Discovering discriminative graph patterns from gene expression data Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2016 Discriminating Graph Pattern Miningfrom Gene Expression Data Articolo in rivista Vai
2015 Searching for repetitions in biological networks: methods, resources and tools Articolo in rivista Vai
2015 Epigenomic k-mer dictionaries: shedding light on how sequence composition influences in vivo nucleosome positioning. Articolo in rivista Vai
2014 Irredundant tandem motifs Articolo in rivista Vai
2014 An evolutionary restricted neighborhood search clustering approach for PPI networks Articolo in rivista Vai
2014 Algorithms and tools for protein-protein interaction networks clustering, with a special focus on population-based stochastic methods Articolo in rivista Vai
2014 Compressive biological sequence analysis and archival in the era of high-throughput sequencing technologies Articolo in rivista Vai
2014 Entropic Profiles, Maximal Motifs and the Discovery of Significant Repetitions in Genomic Sequences Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2013 Restricted Neighborhood search clustering revisited: an evolutionary computation perspective Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2013 Protein Structure Metapredictors Voce (in dizionario o enciclopedia) Vai
2013 Finding repetitions in biological networks: challenges, trends and applications Capitolo o Saggio Vai
2013 Image classification based on 2D feature motifs Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2013 Genomic Databases Characteristics Voce (in dizionario o enciclopedia) Vai
2012 Approximate Matching over Biological RDF Graphs Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2012 Experimental Evaluation of Topological-based Fitness Functions to Detect Complexes in PPI Networks Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2012 A co-clustering approach for mining large protein-protein interaction networks Articolo in rivista Vai
2012 Characterization and Extraction of Irredundant Tandem Motifs Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2012 Complex detection in protein-protein interaction networks: a compact overview for researchers and practitioners Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2012 Extracting string motif bases for quorum higher than two Articolo in rivista Vai
2011 Image Compression by 2D Motif Basis Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2011 Asymmetric Comparison and Querying of Biological Networks Articolo in rivista Vai
2010 Asymmetric Global Alignment of Protein-Protein Interaction Graph Databases Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2010 IP6K gene identification in plant cells via tag discovery Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2010 "Master-Slave" Biological Network Alignment Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2010 New trends in graph mining: Structural and Node-colored network motifs Articolo in rivista Vai
2010 IP6K gene identification by tag search Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2009 Experimental evaluation of protein secondary structure predictors Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2009 Improving protein secondary structure predictions by prediction fusion Articolo in rivista Vai
2009 A summary of genomic databases: overview and discussion Capitolo o Saggio Vai
2009 Discovering Protein Complexes in Protein Interaction Networks Capitolo o Saggio Vai
2009 A technique to search functional similarities in PPI networks Articolo in rivista Vai
2009 Basic Statistical Indices for SeqAn Capitolo o Saggio Vai
2009 Optimal extraction of motif patterns in 2D Articolo in rivista Vai
2009 Extracting similar sub-graphs across PPI Networks Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2008 Singling out functional similarities in graph databases Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2008 Motif Patterns in 2D Articolo in rivista Vai
2008 Discovering meaningful protein-protein interaction modules by a co-clustering based approach Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2008 Protein-protein interaction network querying by a "focus and zoom" approach Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2008 Multi-functional Protein Clustering in PPI Networks Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2007 Bi-GRAPPIN: Bipartite graph based protein-protein interaction networks similarity search Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2007 PINCoC: a Co-Clustering based Method to Analyze Protein-Protein Interaction Networks Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2007 Pattern Discovery In Biosequences: From Simple To Complex Patterns Capitolo o Saggio Vai
2007 Protein Data Condensation for Effective Quaternary Structure Classification Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2006 JSSPrediction: a Framework to Predict Protein Secondary Structures Using Integration Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2006 Protein Secondary Structure Prediction: How to Improve Accuracy by Integration Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2005 Flexible Pattern Discovery with (Extended) Disjunctive Logic Programming Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2004 Discovering Representative Models in Large Time Series Databases Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2004 Riduzione del Traffico nei Sistemi P2P: un Approccio Semantico Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai
2004 Derivazione Efficiente di Pattern Strutturati Frequenti da Database di Natura Biologica Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) Vai