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Il Master di II livello in Tecnologia NGS (Next Generation Sequencing) e tools bioinformatici a supporto della Sanità Pubblica si articola in 7 moduli che includono lezioni frontali, seminari, incontri di studio, esercitazioni, testimonianze di esperti, stage, prova finale, per un totale di 60 CFU / 1500 ore di attività così suddivise:

• Lezioni frontali e studio individuale: 800 ore (CFU 32);
• Tirocinio/stage: 250 ore (CFU 10)
• Work Experience: 75 ore (CFU 3)
• Prova finale/tesi: 375 ore (CFU 15)

Il Master ambisce a fornire gli elementi sia tecnici che metodologici per l’analisi di sequenziamento massivo, l’interpretazione del dato ottenuto con un workflow di laboratorio rivolto a:

1. strategie di sorveglianza delle patologie diffusibili nel panorama della Sanità Pubblica ed implicazioni nella programmazione di strategie preventive basate sulla vaccinazione;
2. identificazione di marcatori microbiologici riferibili ad aggregati di popolazione e rivelabili attraverso approcci innovativi di sorveglianza delle malattie infettive (es. wastewater-based epidemiology);
3. utilizzo della genomica nell’ambito della sorveglianza delle malattie infettive causate da patogeni di interesse sanitario e nell’outbreak investigation, per la comprensione degli aspetti legati non soltanto alla natura del microrganismo e ai suoi meccanismi di evoluzione, ma anche alle dinamiche di trasmissione di un evento con potenziale pandemico e come atto di preparedness prioritario per la rapida individuazione e risposta in Sanità Pubblica;
4. applicazione del whole genome sequencing (WGS), della metagenomica (shotgun metagenomic sequencing), del targeted next generation sequencing (amplicon sequencing) su diverse matrici, quali campioni clinici, isolati batterici, virus e campioni ambientali (aria, acqua e suolo), con particolare riferimento alla rilevazione di agenti patogeni coinvolti in eventi diffusivi naturali (epidemici) e/o deliberati (eventi di bioterrorismo), di interesse civile e militare, che possano rappresentare un rischio grave per la collettività.
5. identificazione e caratterizzazione di marcatori molecolari utili alle attività di controllo, ricerca e tracciabilità delle produzioni alimentari, alla certificazione di prodotto attraverso la ricerca di specie animali e vegetali dichiarate in etichetta, al controllo degli OGM, alla rintracciabilità degli animali allevati, così come al miglioramento dei ceppi starter per le produzioni casearie;
6. diagnostica biomolecolare di precisione, caratterizzazione di profili mutazionali in campo onco-ematologico e clonalità nelle neoplasie linfoidi, analisi genetica nel contesto tissutale;
7. introduzione alla bioinformatica, anche in ambiente UNIX, per la gestione ed elaborazione di “Big-Data” biologici attraverso l’applicazione di strumenti informatici e algoritmi integrati nel workflow manager Galaxy.